Las prestaciones de incapacidad temporal son abonadas directamente por la empresa, en virtud de la colaboración obligatoria, deduciendo esta su importe en el momento de efectuar la cotización a la Seguridad Social.
 
Si durante el periodo de baja médica, el trabajador causase baja en la empresa, sería la mutua quien abonase la incapacidad temporal directamente al trabajador en cuantía igual a la prestación por desempleo.

Así mismo se abonará en pago directo a través de la mutua  los casos de  prórroga expresa a partir del mes 12 de duración de IT.